Nguyên nhân lây nhiễm HIV qua đường máu chiếm gần 86%; qua đường tình dục gần 13% và lây qua mẹ truyền sang con chiếm hơn 1%. Bệnh nhân nhiễm HIV/AIDS nam giới chiếm gần 88%. Điện Biên là một trong những tỉnh phát hiện có người mắc HIV/AIDSmuộn nhẩt trên toàn quốc, nhưng đến nay lại là địa phương dẫn đầu cả nước về tỷ lệ nhiễm HIV/AIDS tính theo số dân – (bằng 0,66%). Đã có 100% số huyện, thị, thành phố và 89/112 xã, phường và thị trấn trong tỉnh phát hiện có người nhiễm HIV/AIDS .

Dự báo dịch HIV/AIDS trên địa bàn tỉnh tiếp tục tăng, đến năm 2010 có khoảng 9.900 người nhiễm HIV. Tỷ lệ người nhiễm HIV/AIDS còn sống trên dân số khoảng 1%; địa bàn tác động của dịch sẽ lan rộng ra các xã, phường trong tỉnh; tỷ lệ lây nhiễm HIV qua đường quan hệ tình dục không an toàn tiếp tục gia tăng.