Theo Nghị định 47, thẩm quyền cấp phép cho cơ sở cai nghiện tư nhân (CNTN) được giao cho Bộ trưởng Bộ LĐTB-XH, nên nhiều cơ sở CNTN còn ngại ngùng. Đến nay, vẫn chưa có cơ sở CNTN nào thực hiện việc đăng ký hoạt động.
Cách đây khoảng 10 năm, một loạt trung tâm, cơ sở CNTN được thành lập ở các thành phố lớn và đi vào hoạt động như Thúy Ái, Tràng An, Thăng Long, Viện Đông y Hà Nội, Hoàn Kiếm, Tân Triều (Hà Nội), Thanh Đa (Tp. HCM)...
Tuy nhiên, bên cạnh những cơ sở CNTN hoạt động nghiêm túc thì vẫn có những cơ sở lừa đảo. Điển hình như một cơ sở CNTN ở Thanh Hóa, lúc đầu hoạt động, quảng cáo rất rầm rộ, nhưng khi đã thu được một món tiền kha khá thì cái biển quảng cáo được dỡ xuống cùng với sự "mất tích" của chủ nhân.
Đó cũng là hậu quả của cái thời "giao thoa" giữa các cơ quan quản lý. Trước khi ban hành Luật Phòng chống tệ nạn xã hội, Bộ Y tế có chức năng cấp giấy phép hoạt động cho các trung tâm, cơ sở CNTN này. Khi Luật Phòng chống tệ nạn xã hội ra đời thì trách nhiệm này lại được giao cho Bộ LĐTB- XH.
Những năm đầu, khi Nghị định hướng dẫn Luật, chưa ra đời là quãng thời gian các cơ sở CNTN "bơ vơ" không ai quản lý, bởi ngành Y tế thì không còn chức năng cấp giấy phép, trong khi Bộ LĐTB-XH lại chưa "vào cuộc".
Nghị định 147 được ban hành là cơ sở pháp lý để quản lý hệ thống cơ sở CNTN. Với chủ trương xã hội hóa công tác cai nghiện, Nghị định này cũng nêu rõ quyền lợi của các cơ sở CNTN như được ưu tiên thuê đất, địa điểm để thành lập cơ sở, được xem xét miễn giảm thuế và vay vốn hoạt động với lãi suất ưu đãi.
Tuy nhiên, ngay cả khi Nghị định này (và cả Thông tư liên tịch giữa Bộ LĐTB- XH và Bộ Y tế ra đời vào tháng 11/2004) thì trong công tác quản lý các cơ sở CNTN vẫn còn một số tồn tại.
Ông Ngô Đồng Hoan - Trưởng phòng Tổ chức cán bộ, Cục Phòng chống tệ nạn xã hội (Bộ LĐTB- XH), người tham gia dự thảo Nghị định 147 cho biết: "Câu hỏi mà hầu hết các cơ sở đặt ra là họ được hưởng chế độ ưu đãi, miễn giảm thuế như thế nào? Khó khăn là chức năng này lại thuộc quy định của Bộ Tài chính.
Chỉ có Bộ trưởng Bộ LĐTB- XH là người có thẩm quyền cấp phép thì "cuộc hành trình" của một bộ hồ sơ xin cấp giấy phép sẽ qua nhiều nấc trung gian và sẽ mất nhiều thời gian".
Cũng chính vì quy định chặt chẽ đó mà cho đến nay, các cơ sở CNTN đã hết hạn hoạt động cũng như các cá nhân, tập thể có nguyện vọng thành lập cơ sở CNTN vẫn còn e ngại khi đăng ký lại hay đăng ký mới